Une bibliothèque est indispensable pour les scientifiques, car elle représente tout le savoir accumulé que les savants pourront consulter suivant les besoins de leurs recherches. Les quinze savants et artistes de l'expédition ne peuvent compter que sur leur propre savoir et celui consigné dans les ouvrages embarqués. C'est pourquoi chacun a emporté ses ouvrages de référence, soit plus de 350 volumes au total, acheté pour un total de 6000 livres (72 000 €). Ce sont des livres de voyage (Cook, Bougainville, Kerguelen...), des livres scientifiques (astronomie nautique, physique, botanique, zoologie, minéralogie...) sans oublier quelques textes philosophiques ou romanesques pour passer le temps.